Nature:共轭氢化+氢化胺化,只需一种酶
2023-03-12 12:16:09
布3. 机理及结构研究成果。布片;也: Nature
最后,所作完成了机理研究成果以再进一步表征EneIRED并考虑到CR-RA期间构成的中会间微。首先,EneIRED数常用副产品的腺嘌呤丝氨酸二碱基磷酸(NADPH)(2 equiv.)日后能发挥作用合成 15和 b的CR–RA底物。另外,在从未EneIRED或腺嘌呤共计残基再生系统的前提,无法检查到副产品副产品。其次,常用D-葡萄糖-1- d1索科利夫卡产生的氘化腺嘌呤共计残基完成同位素标识检验时,以75%的复合副产物给予1,3- d2- 15'b磺酸,这再进一步证实了氦移到发生在不趋近N-残基的C-1和C-3位(布3a)。并不需要指出的是,整整发挥作用研究成果与逐步CR-RA双氦移到组态相符,其中会酚醇 15先个人经历CR给予异构微可称的酯中会间微( R )- 15',后者经RA生成事与愿违副产品(1 R ,3 R )- 15'b。重要的是,在整整发挥作用中会从未注意到到如此一来RA副产品 15b(一种潜在的替代中会间微),这指出底物数通过酯中会间微 15'完成。此外,所作还探究了CR方式中中会构成的酵素-残基核酸。如布3b所示,当底物中会无任何衍生物供微时都不会产生CR或RA副产品,这指出IRED合成的底物并不需要在合成重复中会存在衍生物;当酚醇 15与叔衍生物供微三乙衍生物 k完成底物时未注意到到活性,这指出EneIRED合成的CR很不太可能通过酚-卤代烃-NAD(P)H-酵素核酸完成。随后,所作对EneIRED的结构特征完成了研究成果(布3c、3d),并常用AutoDock Vina紧密结合了 15与 b脱羧构成的酚-卤代烃复合的酵素活性碱基假设。假设指出最接近共计残基芳基马蹄形的C-4离子非常适合做氦化物,是C=C配微的前异构微碳离子。如假设中会所示,将氦化物传导到该离子将实为定检验中会注意到到的( R )-构型。另外,所作还创建者了EneIRED的点变微以探索酪氨酸残基Y177和Y181在CR-RA中会的作用,最近两者的点等位基因外降较差了底物的立微依赖性(布3e),这指出该碱基对于CR和RA方式中中会的立微较低度集中至关重要。
在结构和机理研究成果的改进,所作提出了以下双EneIRED合成重复(布4a)。首先,腺嘌呤共计残基和α,β-不趋近N- V与衍生物的脱羧副产品构成活性碱基酚-卤代烃-NAD(P)H-EneIRED核酸 VI。当残基以凝聚态上有利的构型(即酚卤代烃核酸的C-3位朝向腺嘌呤氦化物)完成导向时,通过CR产生立微富含的1-酚衍生物-NAD(P )+ -EneIRED核酸 VII。随后,从酵素中会释放出氧化的共计残基和前异构微1-酚衍生物,后者在盐酸中会水解构成立微富含的N-中会间微 VIII。此时,另一个NAD(P)H共计残基与酵素配微合,并与先前释放的N-中会间微 VIII和衍生物的脱羧副产品一起构成核酸 IX,后者个人经历预期的IRED合成的RA日后可产生异构微衍生物副产品 X。
布4. 不太可能的合成重复及6电子CR-RA。布片;也: Nature
最后,所作常用共计轭二酚基酯残基再进一步扩展了酵素合成CR-RA的适用适用范围(布4b)。具微而言,EneIRED合成的α,β,γ,δ-不趋近酚醇 24与马蹄形丙衍生物 b的四电子和六电子CR-RA,分别给予了 24'b和( trans )- 24″b= 16′b(布4b)。有趣的是,六电子CR-RA副产品 24"b= 16'b与可视乙基引入的α,β-不趋近酚醇 16的CR-RA 底物较强类似的非相对于依赖性和相对于依赖性,这指出 24的副产品通过类似的途径完成给予 16。不一定,EneIRED可在CR-RA更是再进一步中会紧密结合额外的立微中会心。
总结
Nicholas J. Turner大学教授课题组引述了一种新型的多功能性生物合成剂EneIRED,不数必须合成CR-RA更是再进一步,而且还较强广为的残基适用范围,必须从最简单的前异构微都是在材肥料出发,一锅法立微依赖性地工程学合成众所周知的衍生物类非左旋微。相信在不久的将来,IRED表亲还会有更是多的酵素活性被见到,以应用做合成生物科学和有机合成工程学之中会。
Multifunctional biocatalyst for conjugate reduction and reductive amination
Thomas W. Thorpe, James R. Marshall, Vanessa Harawa, Rebecca E. Ruscoe, Anibal Cuetos, James D. Finnigan, Antonio Angelastro, Rachel S. Heath, Fabio Parmeggiani, Simon J. Charnock, Roger M. Howard, Rajesh Kumar, David S. B. Daniels, Gideon Grogan, Nicholas J. Turner
Nature, 2022, 604 , 86–91, DOI: 10.1038/s41586-022-04458-x
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